More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0759 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  62.11 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  49.48 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  48.47 
 
 		 172 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  43.62 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  47.12 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  43.24 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  44.02 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  40.21 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  40.21 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.21 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  40.21 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  40.21 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  39.15 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  40 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  38.59 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  40 
 
 		 203 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  38.34 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  33.13 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  32.14 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  30.77 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.45 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  31.29 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  32.24 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  30 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.08 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.27 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  26.03 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.48 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01945  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13290)  30.85 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0940209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  26.03 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  28.75 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.51 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  23.29 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.68 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  26.17 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.08 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.23 
 
 		 379 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  27.83 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.64 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  28.23 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  20.77 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.76 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  29.27 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  29.27 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.72 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>