More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0190 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0190  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.05 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.63 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.35 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.65 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  34.16 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  26.95 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.44 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  38.27 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 		 256 aa  60.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  39.47 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  40.43 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.02 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  35 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  38.16 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  38.55 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  27.89 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  38.55 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0073  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  39.51 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  44.16 
 
 		 261 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  32.22 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  25.27 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 230 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  38.75 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2065  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.91 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0370396  normal  0.164629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 252 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 229 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.98 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  26.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.4 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  27.12 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  31.98 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  25.74 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  25.74 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  36.71 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  41.89 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1973  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.21 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  32.05 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  28.41 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.12 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.97 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  25.52 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  31.93 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 253 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  25.84 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  26.97 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  26.97 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.34 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.97 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>