More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4347 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  80.66 
 
 		 221 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  77.52 
 
 		 220 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  76.61 
 
 		 220 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  76.61 
 
 		 220 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  76.28 
 
 		 224 aa  348  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  73.52 
 
 		 222 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  75.69 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  74.77 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  74.77 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.77 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  73.39 
 
 		 220 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  71.43 
 
 		 235 aa  331  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  70.05 
 
 		 224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  68.69 
 
 		 221 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  51.61 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  50.69 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  51.61 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  51.61 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.56 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.31 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.63 
 
 		 238 aa  226  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.17 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  48.61 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  48.62 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  49.08 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  49.08 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  49.08 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  49.08 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.62 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  48.62 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  48.62 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  48.84 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  48.62 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  48.37 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  45.58 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  46.54 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  47.47 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  44.65 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  46.58 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  46.7 
 
 		 222 aa  204  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  45.5 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  43.06 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  43.4 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  44.19 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.33 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  44.04 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  45.58 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  43.87 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  45.96 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  41.71 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  42.38 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  41.71 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  43.54 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  38.89 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.9 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  40.49 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.51 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.91 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  38.54 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  40.78 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.95 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.02 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.37 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.96 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.6 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.88 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.58 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.93 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.63 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.63 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.18 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.47 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.69 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  25.79 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  23.37 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  23.11 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  25.61 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.44 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  25.52 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  24.44 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  25.61 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.44 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.08 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>