157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3975 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  76.47 
 
 		 225 aa  362  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  76.13 
 
 		 228 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  76.13 
 
 		 238 aa  354  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.32 
 
 		 225 aa  347  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  71.17 
 
 		 234 aa  331  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  68.78 
 
 		 227 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  66.97 
 
 		 222 aa  317  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  66.97 
 
 		 222 aa  317  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  66.97 
 
 		 222 aa  317  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  66.97 
 
 		 222 aa  317  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  66.52 
 
 		 222 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  66.52 
 
 		 222 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  66.52 
 
 		 222 aa  316  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 222 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 222 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  67.57 
 
 		 222 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  67.87 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  67.87 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  67.87 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  67.87 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  53.74 
 
 		 220 aa  241  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  56.02 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  52.8 
 
 		 220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  52.8 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  52.27 
 
 		 233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  52.34 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  51.83 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  51.9 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  52.8 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  52.86 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 221 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  50.46 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  45.87 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  46.6 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  44.7 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  42.47 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  43.38 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  41.1 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  42.01 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  40.47 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  42.2 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  40 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  39.73 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  41.01 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  40.38 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  37.9 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.72 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  39.17 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  40.28 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  37.1 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  38.99 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.5 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  37.21 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.53 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  34.34 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.02 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.75 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  23.98 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  28.18 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.24 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  26.92 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.66 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  35.56 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.37 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.3 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.6 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  23.28 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  26.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  26.37 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.11 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  26 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  22.79 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  22.95 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.24 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  29.81 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.27 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  20.1 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  22.02 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>