266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2117 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.25 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  39.46 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  39.57 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.21 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.79 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.16 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
212 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35.64 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.16 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.14 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  30.56 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  31.25 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  30.56 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  39.78 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.87 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  30.77 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  30.23 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  34.75 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  36.28 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.59 
 
 
298 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.68 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  32.04 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  35.48 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  40.51 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  31.28 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.57 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  31.28 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  33.33 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.73 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  33.33 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  33.33 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.77 
 
 
133 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.32 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.19 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  37.63 
 
 
203 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  42.86 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
223 aa  58.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  36.56 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.21 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.13 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  28.28 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  43.84 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.45 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  50.88 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.89 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.65 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  23.53 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  37.68 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  24.08 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  28.42 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  28.42 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  28.42 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.5 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  26.13 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  37.5 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>