131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0839 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  57.55 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.28 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  53.3 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  57.21 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  54.81 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  58.02 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  53.95 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  55.19 
 
 		 220 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  53.49 
 
 		 220 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  53.49 
 
 		 220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  53.02 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  55.09 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  52.61 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  51.42 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  55.3 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  53.7 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  52.78 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  49.07 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  53.06 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  49.51 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  49.31 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.33 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  45.87 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  48.62 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.33 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.98 
 
 		 228 aa  197  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  47.47 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  45.58 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  45.97 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  44.65 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  45.02 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  47.44 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.93 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.64 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.57 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.5 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  42.33 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.4 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.38 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.93 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  39.07 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  38.6 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  38.6 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  38.6 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.6 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  38.6 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  38.38 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  30.72 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.46 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.41 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.73 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  35.51 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.88 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.68 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.75 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  25.96 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  32.63 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  20.36 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.26 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.09 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.19 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.48 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>