158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4614 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  76.47 
 
 
226 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  76.47 
 
 
226 aa  362  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  76.47 
 
 
226 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.21 
 
 
238 aa  353  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.21 
 
 
228 aa  352  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  71.62 
 
 
234 aa  341  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.09 
 
 
225 aa  336  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  67.13 
 
 
227 aa  310  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  65.6 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  65.6 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  65.6 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  65.6 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  65.6 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  66.51 
 
 
222 aa  305  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  66.51 
 
 
222 aa  305  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  66.51 
 
 
222 aa  305  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  66.51 
 
 
222 aa  305  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  66.05 
 
 
222 aa  304  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  66.05 
 
 
222 aa  304  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  66.05 
 
 
222 aa  304  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  66.05 
 
 
222 aa  304  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  66.05 
 
 
222 aa  304  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  53.27 
 
 
220 aa  244  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  53.21 
 
 
220 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  52.29 
 
 
220 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.29 
 
 
220 aa  241  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  52.05 
 
 
220 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  51.13 
 
 
233 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  51.6 
 
 
220 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  52.34 
 
 
224 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  50.45 
 
 
224 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  50.68 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  52.07 
 
 
221 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  49.31 
 
 
227 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  50.95 
 
 
221 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  47.95 
 
 
222 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  51.9 
 
 
221 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  50.93 
 
 
235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  45.5 
 
 
230 aa  218  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  48.54 
 
 
222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  46.51 
 
 
223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  45.45 
 
 
221 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  44.09 
 
 
221 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  44.55 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  43.72 
 
 
220 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  43.26 
 
 
220 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  44.7 
 
 
229 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  41.36 
 
 
220 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  41.36 
 
 
220 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  41.94 
 
 
222 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.67 
 
 
221 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
220 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  40.45 
 
 
220 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  42.33 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  41.94 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  39.91 
 
 
226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  38.81 
 
 
217 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  42.79 
 
 
224 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  41.01 
 
 
233 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  40.09 
 
 
224 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  38.99 
 
 
228 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  36.11 
 
 
227 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  37.27 
 
 
223 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.11 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.57 
 
 
230 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 
258 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 
230 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 
223 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  32.32 
 
 
201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.31 
 
 
227 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  24.55 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.52 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  38.46 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  38.89 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0554  hydrolase  28.18 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0739  hydrolase  24.85 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.715617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  23.72 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  25.14 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  24.24 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.86 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 
256 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  24.39 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  25.81 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  24.6 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.6 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  24.6 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  24.6 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  24.6 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  24.6 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0750  hydrolase  25.75 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  27.08 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>