151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0116 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  73.36 
 
 		 224 aa  330  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  71.49 
 
 		 224 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  72.99 
 
 		 221 aa  323  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  72.9 
 
 		 220 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  72.43 
 
 		 220 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  72.43 
 
 		 220 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  73.46 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  71.5 
 
 		 220 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  71.03 
 
 		 220 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.56 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  68.25 
 
 		 222 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  69.19 
 
 		 221 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  68.69 
 
 		 220 aa  309  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  67.29 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.09 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.09 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  50.93 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.69 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.72 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  49.76 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.76 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  49.76 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  49.76 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  49.76 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  49.29 
 
 		 222 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  49.29 
 
 		 222 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  49.29 
 
 		 222 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  49.29 
 
 		 222 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  49.29 
 
 		 222 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  49.29 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  49.29 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  49.29 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  49.29 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  44.04 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  45.07 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  46.01 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  46.01 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  43.12 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  44.91 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  43.32 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  43.4 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  44.39 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  44.33 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  42.73 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  40.09 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  41.4 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  41.78 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.4 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  42.08 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  41.12 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  43.23 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.64 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  42.62 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  42.62 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.46 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  39.9 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.34 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.34 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.34 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.4 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.48 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.01 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.37 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  21.36 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  30.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.76 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  24.17 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.53 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.76 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.76 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.76 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.03 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.62 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  24.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  22.56 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  24.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.11 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>