188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2059 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  32.55 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  33.17 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.17 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  33.33 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.58 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.49 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  30.92 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  32.67 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  31.89 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.18 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  30.66 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.36 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  34.04 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  31.38 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.23 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  28.9 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.69 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.67 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.95 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.11 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  29.78 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  29.78 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  27.06 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.77 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.21 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  30.39 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  26.52 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  31.02 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.78 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.53 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.73 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  27.06 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.11 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.63 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.11 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  25.11 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  24.86 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  30.48 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.09 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 267 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  28.88 
 
 		 263 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.88 
 
 		 263 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  28.49 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.68 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.06 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.7 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.27 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.48 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.48 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.88 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  24.86 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.88 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.34 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.36 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.47 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.31 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.31 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.31 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.23 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  27.23 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  27.13 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  26.06 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  28.66 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  24.24 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  27.07 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.97 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  24.82 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  24.31 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  26.62 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1345  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  27.84 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  25.97 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1412  enolase-phosphatase  27.84 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.185542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  28.71 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  33.75 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  24.6 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.17 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>