79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2420 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 227 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  47.44 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  48.37 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  38.01 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.7 
 
 		 221 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  40.93 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  43.06 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  40.93 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  42.33 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  42.33 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  37.9 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  37.44 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  43 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  38.01 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.63 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.17 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  37.86 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  38.36 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  38.53 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  40.93 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  37.93 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  38.66 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  38.66 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  39.69 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  39.9 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  38.66 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.61 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.39 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  39.38 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  38.5 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.73 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  37.63 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  37.63 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  37.63 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  37.63 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  37.63 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.87 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  37.44 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  38.27 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.08 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  36.36 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  36.36 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  35.86 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  31.31 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.17 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.07 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>