204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0177 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  100 
 
 		 220 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  89.09 
 
 		 220 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  88.64 
 
 		 220 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.18 
 
 		 220 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  84.4 
 
 		 233 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  83.56 
 
 		 220 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  82.65 
 
 		 220 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  82.65 
 
 		 220 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  77.25 
 
 		 221 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  72.02 
 
 		 222 aa  339  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  73.73 
 
 		 235 aa  330  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  73.93 
 
 		 221 aa  328  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  70.45 
 
 		 224 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  72.09 
 
 		 224 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  68.69 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  53.27 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  53.74 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  53.74 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  53.74 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.02 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  50.93 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.58 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  50.7 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.11 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.63 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  50.69 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  50.69 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  50.69 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  50.69 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  50.69 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  49.3 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.3 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  49.3 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  48.84 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  48.84 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  48.84 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  48.84 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 220 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  49.3 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  50.23 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  50.7 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  48.84 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  48.84 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  47.39 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  48.84 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  48.82 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  45.87 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.91 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  44.13 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  44.86 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  45 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  43.46 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  41.98 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  43.33 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  41.92 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.91 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.91 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  39.72 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.93 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  39.25 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  40 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.21 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.73 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  25.88 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  23.58 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  25.48 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  23.27 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.75 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.36 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.76 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.76 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.66 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  21.56 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.24 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.31 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  24.61 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.26 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.73 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  26.04 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.24 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.24 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 728 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.31 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  30.93 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.32 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.27 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  23.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  25.26 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>