110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3777 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  100 
 
 		 222 aa  464  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  99.1 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  99.55 
 
 		 222 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  99.1 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  99.55 
 
 		 222 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  99.1 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  99.55 
 
 		 222 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  99.55 
 
 		 222 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  99.1 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  85.14 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  85.14 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  85.14 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  85.07 
 
 		 222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  85.14 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  83.71 
 
 		 227 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.41 
 
 		 225 aa  308  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.25 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  63.8 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  66.05 
 
 		 225 aa  304  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.71 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  50 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  51.63 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  51.63 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  52.36 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  51.16 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  49.52 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  49.31 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  45.58 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  44.14 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  49.76 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  47.93 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  48.58 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  49.05 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  46.12 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  43.12 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  41.74 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  41.74 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  41.01 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  38.81 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  40.55 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  41.47 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  40.09 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  40.09 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  39.07 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  40.09 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  39.17 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  40.83 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  41.31 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.25 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.79 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  38.25 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.07 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  36.53 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  36.15 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.79 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  36.87 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.78 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.86 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  24.12 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  25.75 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0739  hydrolase  29.14 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.715617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  37.66 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  32.18 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.32 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.1 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.76 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1413  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  26.5 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.27 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.68 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  24.57 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.43 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1734  hydrolase  27.52 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  22.94 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.76 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.38 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.1 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  24.1 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.7 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  26.52 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>