204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4490 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  59.62 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  59.62 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.21 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  65.69 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  39.23 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  36.7 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  36.7 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  36.7 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  36.7 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  36.7 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  37.16 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  37.16 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  37.16 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  35.83 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  35.83 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  37.02 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  35.83 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.83 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  35.83 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  37.23 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  35.83 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  35.83 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  35.83 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  37.23 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  37.02 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  35.45 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  38.12 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.05 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.84 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.76 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.77 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.06 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  27.04 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  24.64 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.46 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.87 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  27.13 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.24 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  34.34 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.05 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.43 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  23.11 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.47 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  25 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  30.62 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  28.68 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  48.21 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  35.14 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  25.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  25.82 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  25.82 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  25.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  34.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  27.09 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3587  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.64 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  23.59 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  34.67 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  26.01 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.38 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  41.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  21.89 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  27.92 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.56 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.62 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  22.93 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.31 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.37 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>