50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1892 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  69.54 
 
 
198 aa  289  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.26 
 
 
196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  49.25 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  28.49 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.19 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.19 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.19 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.19 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.19 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  28.42 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  28.65 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  28.04 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  29.32 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  28.65 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  26.34 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  26.34 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  26.34 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  28.49 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26.37 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.63 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  21.28 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.16 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  29.73 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.2 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.59 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.86 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.08 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  23.32 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  22.64 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  23.96 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  23.37 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.47 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  28.33 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  23.91 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  22.73 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  23.96 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>