185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4958 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  100 
 
 
201 aa  406  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  31.47 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  31.47 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  31.47 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  31.47 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  30.2 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.79 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  24.1 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.88 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  26.13 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.06 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
203 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  32.69 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.52 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  34.51 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.68 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.21 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  23.2 
 
 
198 aa  54.7  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  41.56 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.23 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.62 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  24.72 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.31 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.78 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.27 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.32 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.63 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  24.61 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  34.38 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  29.79 
 
 
217 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.34 
 
 
133 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.19 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  30.77 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  34.34 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  29.81 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  37.7 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.33 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.19 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  26.52 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  34.67 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.41 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.39 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.55 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.71 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  22.22 
 
 
196 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.15 
 
 
199 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  28 
 
 
212 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3587  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35 
 
 
228 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  22.22 
 
 
196 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.03 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  28.7 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  27.52 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
216 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  25.68 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  28.42 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  40.35 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  33.9 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  28.81 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  29.87 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.76 
 
 
133 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1846  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  32.97 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  26.96 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  26.96 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  26.96 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  39.34 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  26.96 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  26.96 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>