100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02292 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  100 
 
 
205 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.8 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  40.4 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.9 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  38.34 
 
 
204 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  36.82 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  36.82 
 
 
217 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  37.19 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  36.82 
 
 
217 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  36.82 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  36.82 
 
 
268 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  36.32 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  26.13 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  27.96 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.93 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.17 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.26 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.11 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.29 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.15 
 
 
205 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  23.74 
 
 
209 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  29.68 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  29.03 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
378 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.2 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  32.04 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  33.98 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  27.78 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  36.62 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  39.02 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  24.17 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.34 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.24 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  28.03 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  34.69 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.8 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  23.92 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.07 
 
 
133 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  34.11 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  36.21 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  28.03 
 
 
196 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
203 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  28.03 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  31.73 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  26.67 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  28.03 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.66 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.68 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  37.84 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  21.05 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  43.4 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  38.71 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.5 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  32.32 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.9 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.09 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.9 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.93 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  31.82 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  31.82 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  31.82 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  31.82 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  31.82 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  41.38 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  36.21 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.93 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  37.84 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  35.44 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.68 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.62 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  31.25 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  38.75 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  26.18 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.63 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.74 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  37.1 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  25.6 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.51 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  25 
 
 
215 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.32 
 
 
195 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25.9 
 
 
199 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
215 aa  41.2  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05173  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 
569 aa  41.2  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.167398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>