165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3008 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.5 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  33.16 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  32.07 
 
 
198 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  33.16 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  31.58 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  31.91 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  31.91 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  31.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  31.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  31.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  31.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  31.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  30.53 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  30.53 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  30.85 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  30.53 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  30.53 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.04 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  31.02 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  31.22 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  31.22 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  31.22 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  33.7 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  29.1 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.04 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.5 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.86 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.22 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  28.57 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 
204 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.72 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  25.13 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  24.19 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.27 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.63 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 
291 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  25.68 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.42 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  22.89 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.52 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.49 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  25.79 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  40 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26.2 
 
 
205 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.6 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  28.14 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  23 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.35 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.91 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  22.47 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.28 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.7 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  25.65 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.82 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.15 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.21 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.91 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  27.05 
 
 
456 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  25.94 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  23.76 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  23.79 
 
 
231 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  26.26 
 
 
363 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  39.68 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  23.81 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.91 
 
 
227 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  25.77 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.26 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.3 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
378 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.02 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.52 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  24.51 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  26.2 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  28.03 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  24.51 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  24.51 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6628  HAD family hydrolase  24.31 
 
 
205 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563326  normal  0.0579332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  24.88 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>