131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1958 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 213 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  67.65 
 
 		 204 aa  308  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3597  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.3 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000239602  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  33.9 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  30.53 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  28.57 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.35 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.93 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  41.43 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.58 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  38.67 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  30.09 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.37 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  26.79 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.24 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  22.28 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  25.71 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  27.47 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  22.6 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.38 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  35.37 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  29.31 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  23.53 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.35 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.04 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  33.77 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.93 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  28.16 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.14 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.59 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.29 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  29.2 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.67 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  29.2 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.49 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  22.16 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  24.79 
 
 		 456 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  25.47 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.04 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.95 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.23 
 
 		 456 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.38 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  31.82 
 
 		 163 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  24.4 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.18 
 
 		 133 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  23.68 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  34.85 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  23.94 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.23 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  22.33 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  24.43 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  28.7 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01012  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12880)  28.69 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103683  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.75 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  33.33 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  24.3 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  23.74 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.39 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.48 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.29 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.31 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  24.6 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.21 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>