86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7538 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  100 
 
 
232 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  41.58 
 
 
194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.96 
 
 
206 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  38.54 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.25 
 
 
203 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.26 
 
 
195 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.83 
 
 
205 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.5 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  26.84 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  43.01 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.75 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.99 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  36.54 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  35.58 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.28 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  38.37 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.8 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  23.76 
 
 
206 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.93 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.11 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.1 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.59 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  44.83 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.4 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  25.51 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.29 
 
 
298 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.32 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  27.98 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.72 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  26.01 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  24.56 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  34.43 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.1 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.14 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  39.02 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  26.51 
 
 
199 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  32.05 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  33.33 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.27 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  35.09 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  33.64 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  33.64 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  29.48 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  27.12 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  27.12 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  27.12 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  33.33 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  31.87 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.97 
 
 
133 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  28.34 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.51 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.98 
 
 
204 aa  42  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  45.65 
 
 
206 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>