239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4019 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  57.75 
 
 
218 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  54.72 
 
 
214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.52 
 
 
224 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  52.83 
 
 
216 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.42 
 
 
216 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.33 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.95 
 
 
210 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.61 
 
 
211 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.05 
 
 
133 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  42.86 
 
 
133 aa  85.5  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  30.49 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  28.83 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.15 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.5 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.37 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  30.7 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  27.27 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  27.15 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  26.24 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  28.44 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.77 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.05 
 
 
195 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.8 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  33.03 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  26.18 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  29.86 
 
 
196 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  29.86 
 
 
196 aa  62  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  29.86 
 
 
196 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  29.81 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.08 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.85 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  38.69 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.34 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  28.38 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
198 aa  59.3  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  27.49 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.91 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35.44 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.51 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3597  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.1 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000239602  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.64 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.55 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  35.45 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.17 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.75 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  35.04 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05173  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 
569 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.43 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.14 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.89 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  30.28 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  27.41 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  28.7 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  28.7 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  28.7 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  30.36 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  28.7 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.68 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  28.7 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  22.34 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  30.11 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.58 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  34.83 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.51 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  25.35 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  29.28 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  34.38 
 
 
198 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  41.25 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 
212 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  26.49 
 
 
208 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
230 aa  52  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25.52 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.13 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3902  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  28.07 
 
 
664 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>