228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6398 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 291 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  46.7 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0908  hypothetical protein  55 
 
 		 86 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1182  HAD family hydrolase  44.51 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142459  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1121  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.08 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.26 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  36.96 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  43.84 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17550  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.8 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0434357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  32.81 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  47.14 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.9 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  40.17 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  39.36 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.34 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.24 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  39.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  32.58 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 220 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  33.7 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.73 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  37.6 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.96 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.53 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  34.45 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  30.09 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  32.5 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  26.61 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.27 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.28 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.96 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 378 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.64 
 
 		 203 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.74 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.54 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.29 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  32.11 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 199 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  40 
 
 		 200 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  37.65 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.3 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.78 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.47 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 199 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  35.14 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.47 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  35.14 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  28.71 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.47 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  30.7 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  36.15 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  35.14 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  35.14 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  35.14 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.05 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.84 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  31.25 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3597  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.35 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000239602  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  26.61 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  26.61 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1340  hypothetical protein  46.75 
 
 		 87 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.43 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  26.61 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  36 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  43.18 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.66 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  30.99 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.96 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  22.95 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  25.69 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  32.48 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  25.69 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>