247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2037 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  36.5 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.06 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.62 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.8 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.93 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.47 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  27.72 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.56 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  26.74 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.57 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  26.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  26.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  26.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  26.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  26.7 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.56 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  26.14 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  26.14 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25.57 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.75 
 
 		 298 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.57 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  27.42 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  28 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.27 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.57 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.66 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  24.18 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.76 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  23.63 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  23.63 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.1 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  29.23 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  27.71 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  24.86 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  25.84 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  36.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.84 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  24.85 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.12 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3597  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.89 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000239602  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.16 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  25.52 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.73 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 378 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  24.29 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  25 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.2 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.65 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  28.78 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  32.99 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  34.21 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  25.65 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  24.48 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  39.39 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  25.95 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  36.36 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.25 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  26.7 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  31.43 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  31.43 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.93 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  36.17 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  31.43 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  26.88 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>