88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1787 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0394  hydrolase  51.26 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  49.75 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  43.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  44.33 
 
 		 378 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.61 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.35 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.53 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.87 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.76 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.17 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  29.14 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.87 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.64 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.98 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  26.82 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.33 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  26.23 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  32.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  26.98 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.46 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  32 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.59 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  29.91 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.43 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  25.68 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  37.78 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  20.71 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  31.37 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  30.17 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  24.06 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  31.37 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.21 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  31.37 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  31.37 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  31.37 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  35.59 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  32.05 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.81 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  26.89 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  25.82 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  25.54 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 245 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 245 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 220 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  34.44 
 
 		 216 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 242 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>