284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0784 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
216 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  66.36 
 
 
214 aa  293  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  58.13 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.83 
 
 
232 aa  211  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.46 
 
 
224 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43 
 
 
216 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.75 
 
 
224 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.95 
 
 
210 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.23 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  30.05 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.66 
 
 
133 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.24 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.19 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  28.7 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  31.05 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.96 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  29.41 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  28.26 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.17 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  27.31 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  34.29 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.84 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  32.62 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  32.62 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  32.62 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  32.68 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  32.14 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
195 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.69 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  44.29 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  44.87 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.07 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  31.29 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  31.29 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  31.29 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  31.29 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  31.29 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  36.21 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  33.1 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  31.61 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  32.69 
 
 
205 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  31.54 
 
 
198 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  40 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  42.68 
 
 
163 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  27.11 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.61 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  46.43 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
378 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  35.19 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.74 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  49.12 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
205 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  39.47 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.18 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.05 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  38.57 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  35.79 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.67 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0566  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  30.71 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  27.67 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.43 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3587  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  41.33 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  35.06 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  34.34 
 
 
222 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 
218 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  35.05 
 
 
218 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.3 
 
 
217 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  27.1 
 
 
211 aa  52  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.52 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
198 aa  52  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
231 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.46 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  28.86 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  37.31 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>