190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4304 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  99.5 
 
 
199 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  88.94 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  89.45 
 
 
199 aa  380  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  85.43 
 
 
199 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  66.84 
 
 
198 aa  294  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  70.26 
 
 
196 aa  289  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  70.26 
 
 
196 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  69.74 
 
 
196 aa  287  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  65.64 
 
 
203 aa  287  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  65.13 
 
 
203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  66.84 
 
 
203 aa  277  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  66.33 
 
 
196 aa  267  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.7 
 
 
209 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  35.26 
 
 
231 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.48 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.93 
 
 
211 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.6 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.02 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  26.63 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  26.74 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  29 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  25.28 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  28.92 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.65 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  27.84 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.7 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.61 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  28.19 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.67 
 
 
224 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.35 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.2 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  29.37 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  23.2 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  31.29 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  25.12 
 
 
217 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  26.57 
 
 
213 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.9 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  29.17 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  23.44 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  26.13 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  24.88 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.67 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.21 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  24.78 
 
 
216 aa  54.7  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  22.78 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  24.86 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.57 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  27.07 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.14 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  24.31 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.37 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  30.83 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  24.31 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.05 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  24.31 
 
 
217 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  24.31 
 
 
217 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  24.31 
 
 
268 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 
227 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  32.29 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  22.11 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  24.38 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>