233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0532 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.57 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  32.77 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  38.54 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  35.34 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.05 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  30.08 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.89 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  42.68 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  40.91 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.55 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  39.68 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  39.68 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.6 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  25.19 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.93 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.8 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.4 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  39.68 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  37.84 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.43 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.43 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25.36 
 
 		 230 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.96 
 
 		 219 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.15 
 
 		 236 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  32.91 
 
 		 207 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  41.07 
 
 		 215 aa  50.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  37.18 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  29.41 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.51 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.03 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  37.88 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.37 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.33 
 
 		 235 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.91 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  36.76 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  27.01 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  30 
 
 		 225 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  39.77 
 
 		 226 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.21 
 
 		 238 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  23.36 
 
 		 221 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.51 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.19 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.68 
 
 		 238 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.3 
 
 		 227 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 208 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 199 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  27.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 205 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  25 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6628  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563326  normal  0.0579332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.67 
 
 		 254 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  25 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  25 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 206 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  25 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.48 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.83 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  27.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>