168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1288 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.93 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.45 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.7 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  35.4 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.29 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  29.19 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6628  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563326  normal  0.0579332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.12 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  29.02 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  29.02 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.3 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  29.02 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  29.02 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  27.45 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  26.7 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.71 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  28.26 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  39.47 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  24.76 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  40.24 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  26.53 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.37 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  24.46 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  23.44 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  26.19 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  28.5 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.68 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  28.72 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 378 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.87 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.59 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  38.54 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  23.44 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.24 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  25.77 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  22.97 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  28.11 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  28.11 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.96 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.48 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  28.11 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  32.05 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.46 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.59 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.18 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  23.28 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.68 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.07 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  23.64 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.26 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  23.79 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  24.56 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  34.65 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  41.82 
 
 		 133 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 		 133 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  30.11 
 
 		 252 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  30.11 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.87 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.11 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>