100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0002 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  100 
 
 
200 aa  408  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.22 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.73 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.76 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
209 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.53 
 
 
217 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
207 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.75 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  29.95 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  29.3 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  27.23 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  27.23 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  26.88 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  27.23 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  25.81 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.69 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  26.4 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  27.36 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  24.86 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  27.13 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  24.31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.31 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25.5 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.12 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  23.2 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  23.2 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  23.2 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  23.2 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  23.2 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  23.7 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.49 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  36.47 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.94 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  30.85 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  21.05 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  28.02 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  29.63 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  28.7 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
223 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  22.16 
 
 
203 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.54 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.39 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  31.58 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  28.57 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.47 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.1 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  25.86 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.53 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.61 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  27.52 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 
298 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  26.27 
 
 
204 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.27 
 
 
201 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.46 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.47 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  24.24 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 
211 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.48 
 
 
204 aa  45.1  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.54 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  23.91 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.21 
 
 
224 aa  44.7  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  35.09 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.92 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  23.83 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.09 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.3 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  21.84 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  29.73 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  21.95 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.63 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.42 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.86 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  25.88 
 
 
212 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.34 
 
 
194 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
200 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.78 
 
 
209 aa  42  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.26 
 
 
238 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  34.57 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>