183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0900 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  100 
 
 		 196 aa  381  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  51.55 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  48.7 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  47.64 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.27 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  42.35 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.85 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.49 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  26.77 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  24.38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  28.22 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  28.64 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.76 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.79 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  26.53 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0764  HAD family hydrolase  27 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.523693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  26.37 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  24.26 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  23.41 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3272  HAD family hydrolase  23.78 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  24.38 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  25.38 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  24.38 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  22.46 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  22.84 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.61 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  23.88 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0874  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12893  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  25.24 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  22.28 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  22.34 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  22.89 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.54 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.12 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  35.34 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  26.06 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.98 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  20.91 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  25.52 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.85 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  19.27 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  20.19 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  26.77 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  25 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  24.15 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  23.7 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.23 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  24.07 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.96 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  20.25 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  23.81 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  23.81 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  24.49 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  27 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  23.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  23.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  23.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  23.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  23.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.16 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.96 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  22.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.76 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  20.1 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22 
 
 		 298 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  24.47 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>