234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3728 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
224 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  59.42 
 
 
218 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  54.33 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.52 
 
 
232 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  51.46 
 
 
216 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.56 
 
 
216 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.47 
 
 
224 aa  124  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.07 
 
 
210 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 
207 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.22 
 
 
133 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  43.81 
 
 
133 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  31.4 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  31.4 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  31.9 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  28.64 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.18 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.36 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  45.57 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.33 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  31.33 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  31.33 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  23.44 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  30.67 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  30.67 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  30.67 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  30.67 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  30.67 
 
 
199 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  31.25 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  31.25 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  38.04 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  30.67 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  31.25 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  41.1 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  34.69 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  42.86 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.38 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  33.67 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  38.04 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.64 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.51 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  30.56 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.36 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  32.48 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  22.6 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  42.03 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
206 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40.3 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  32.67 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.3 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  38.67 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
378 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  28.47 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  30.49 
 
 
205 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 
234 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
258 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  34.44 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  29.41 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.73 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  25 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  34.43 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.66 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  39.06 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  32.46 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  30 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  36.07 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  30.19 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.62 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  32.99 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.04 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  38.16 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 
298 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  42.86 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  31.15 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.24 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>