74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  38.86 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  34.5 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.96 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  35.47 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  39.09 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  25.39 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  28 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  27.07 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  28.08 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  32.52 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  40.91 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  24.1 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.96 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  33.33 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.13 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.83 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.48 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  28.28 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  35.51 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  32.69 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.63 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  39.22 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  38.1 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  27.82 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.72 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.47 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.48 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  34.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  37.35 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  34.41 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0394  hydrolase  28.06 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  27.23 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.41 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0874  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12893  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.22 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  26.71 
 
 		 163 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.96 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.15 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>