203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0571 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.07 
 
 
203 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.15 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  31.63 
 
 
208 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  32.16 
 
 
231 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  31.41 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 
211 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.06 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  28.49 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.48 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  29.1 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  29.78 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  29.3 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  28.65 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  28.65 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  28.65 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25.13 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25.84 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  25.28 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  25.28 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  25.28 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  25.28 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  25.28 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  27.94 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  22.44 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  31.75 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  40.38 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  30.39 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  26.87 
 
 
202 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  41.86 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  23.53 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.53 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  25.76 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  23.67 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  27.64 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.8 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 
291 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  23.4 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  27.27 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.32 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.73 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  29.84 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.64 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0245  HAD family hydrolase  25.27 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  36.08 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.44 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.92 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  24.76 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  26.73 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.49 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  23.2 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.48 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.3 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.12 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  25.6 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  27.04 
 
 
229 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.17 
 
 
456 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.56 
 
 
205 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.06 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  25.94 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.03 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.6 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.83 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
378 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.86 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.3 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  28.46 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  22.05 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  26.19 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  25.91 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  28.12 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.29 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.2 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  25.98 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>