189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0572 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  80.68 
 
 		 378 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.72 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0394  hydrolase  44.9 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  42.49 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.61 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.71 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.93 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.25 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  26.88 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  34.62 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  30.94 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.58 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  26.54 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.39 
 
 		 267 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.04 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  26.87 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.45 
 
 		 263 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  27.55 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  25.52 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.91 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  29.71 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  23.76 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  24.6 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  27.59 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.3 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  35.79 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.63 
 
 		 133 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  23.76 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  25 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  23.81 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.62 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.16 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  26.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  26.32 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  26.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  26.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  26.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  26.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.06 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  23.63 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.35 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.04 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  32.53 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  27.51 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  26.23 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  25.65 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  24.47 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  24.47 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.16 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.13 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.38 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  28.74 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>