92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1918 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  99.08 
 
 
268 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  99.51 
 
 
204 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  91.13 
 
 
204 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  69.95 
 
 
204 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  67.98 
 
 
204 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.53 
 
 
204 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  36.82 
 
 
205 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.18 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  31.47 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.4 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25.41 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25.41 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  26.82 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.82 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  25.41 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  25.41 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.7 
 
 
194 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  46.15 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  24.86 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  26.49 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.13 
 
 
211 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  24.31 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  31.72 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  25.41 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.39 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  22.11 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  27.05 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  26.47 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40.58 
 
 
133 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  24.86 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.37 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  24.51 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.61 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.06 
 
 
133 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.62 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  25.5 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
272 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
272 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.72 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
272 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3640  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.87 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.55 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.88 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.64 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  27.88 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  24.58 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.46 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3597  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.52 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000239602  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  22.94 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
378 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.7 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  22.56 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  24.19 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  24.63 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  29.87 
 
 
218 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  24.63 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  26.77 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.34 
 
 
211 aa  41.6  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>