More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2484 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  58.13 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.42 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  57.55 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.75 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.66 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.42 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  44.12 
 
 		 133 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.3 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  30.09 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  30.56 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.56 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  28.7 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.54 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.8 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.8 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.8 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  29 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.8 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  29 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  29 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  29 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.8 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.8 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  29 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  31.08 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.29 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.29 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.29 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  34.51 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  29.09 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  33.57 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  33.57 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  33.57 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  27.69 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.06 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  30.3 
 
 		 986 aa  62.4  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  34.31 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.25 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  35.4 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.4 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  27.6 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  32.65 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.15 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.59 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.76 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  38.46 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  33.1 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  26.89 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  23.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  20.19 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.23 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  25.55 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  39.51 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  26.28 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.28 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  33.6 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  31.19 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.33 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  22.78 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.07 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  29.86 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  41.89 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.22 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  34.21 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.02 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  31.25 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.45 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  32.5 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 378 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  31.58 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.35 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.65 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  32.43 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  38.27 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  30.77 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>