229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0732 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.73 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  44 
 
 
203 aa  176  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.71 
 
 
212 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
234 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
234 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.36 
 
 
234 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.82 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.66 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  32 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  28.14 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  38.39 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.77 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.96 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.51 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.04 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.93 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  25 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  25.97 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.39 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.59 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.97 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  31.09 
 
 
317 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.68 
 
 
245 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.27 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.34 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  22.97 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.34 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.01 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.12 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.58 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  27.07 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  25.51 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  25.95 
 
 
245 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.91 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  36.63 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5896  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.2 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  33.62 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.17 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.05 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.69 
 
 
229 aa  52  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  27.49 
 
 
232 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.65 
 
 
216 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  35.29 
 
 
217 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.85 
 
 
263 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  27.96 
 
 
232 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
242 aa  51.6  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
259 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  26.51 
 
 
235 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  32.14 
 
 
251 aa  51.6  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  34.31 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
269 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  25.66 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  30 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  25.52 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.4 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.06 
 
 
291 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  33.63 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  29.84 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.37 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.84 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.84 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.84 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.84 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  33.93 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  32.35 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.49 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.32 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  30 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  34.34 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  25.51 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  27.97 
 
 
282 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  31.4 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  30.91 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  32.29 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  29.58 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.97 
 
 
583 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>