138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1323 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  100 
 
 
269 aa  543  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  74 
 
 
250 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  75 
 
 
252 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  76.02 
 
 
251 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  31.5 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1233  hydrolase  31.44 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  27.95 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.46 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.89 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.31 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.63 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.55 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
234 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  38.32 
 
 
233 aa  55.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.04 
 
 
583 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.9 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.7 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.19 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  34.58 
 
 
233 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  29.64 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  34.58 
 
 
233 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  24.05 
 
 
317 aa  52.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.93 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  27.06 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
220 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
248 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.45 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.53 
 
 
217 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  28.84 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.75 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 
227 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.52 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.27 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.94 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  31.97 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.61 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.71 
 
 
229 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
218 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.29 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
240 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.02 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.99 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.59 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  28.96 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  38.46 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31.03 
 
 
228 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
239 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
239 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.32 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  30.56 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.82 
 
 
230 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
234 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
238 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
234 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  33.66 
 
 
205 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 
232 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  26.85 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  27.48 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.51 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.64 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.31 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  27.31 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
543 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  39.71 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  24.49 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  27.48 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  23.93 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.16 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  27.66 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>