227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4077 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  100 
 
 		 238 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  44.21 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  43.04 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  40.66 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  36.29 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  36.29 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  33.33 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  33.33 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  33.33 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  33.33 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.98 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  34.18 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  35.44 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  34.85 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  34.02 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  32.91 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  34.02 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  35.04 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  35.04 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  35.44 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  35.04 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  35.84 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  35.47 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.3 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.51 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  35.71 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  34.32 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.32 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  33.76 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  33.33 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  35.64 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  33.2 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  32.37 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.35 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  32.91 
 
 		 256 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  31.74 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  32.46 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.19 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  29.82 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.84 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  29.54 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.09 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.26 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.69 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  28.82 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.08 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.94 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  25.21 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.21 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.5 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.3 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.86 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.94 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.14 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.79 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.47 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  23.89 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  33.03 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  26.17 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  22.75 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>