252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4126 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  53.97 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  53.62 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  55.95 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  51.49 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  51.91 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  51.91 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.54 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  53.3 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  52.12 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  52.12 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  52.12 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  52.34 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  52.34 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  48 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  48.09 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  40.85 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  38.7 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  39.57 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  40 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  40.66 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  36.08 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  35.24 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  35.24 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  35.24 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  35.24 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  34.8 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  34.87 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  37.66 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  33.47 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  36.4 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  34.36 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.73 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  37.39 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.44 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  35.22 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  32.19 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  33.04 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  33.04 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  32.19 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  33.04 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.84 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.04 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  32.07 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  33.77 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  34.16 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.82 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  31.49 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  31.49 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  31.84 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.16 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.84 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.03 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  28.05 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.1 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25.59 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.8 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  33.1 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.17 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.03 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  22.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  27.04 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>