More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2493 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  58.77 
 
 		 259 aa  225  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  60.41 
 
 		 231 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.82 
 
 		 243 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  56.16 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  55.12 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  55.67 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.67 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  55.67 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  52.5 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  50.72 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  49.51 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.75 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  53.47 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  50.24 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  47.55 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  50 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  44.61 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  40.53 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.35 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  40.09 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  40.78 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  36.59 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.06 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  40.78 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  38.05 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.83 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  36.8 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  36.4 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  37.56 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  36.4 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  36.1 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  37.13 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  37.13 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  36.14 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  36.14 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  36.14 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  36.14 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  36.23 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  35.86 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  39 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  36.36 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  34.16 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  33.65 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  35.15 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  37.19 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.91 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  32.51 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  33.01 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  37.07 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 240 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  32.04 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.34 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.34 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  34.16 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  33.83 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  34.16 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  33 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  34.16 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  34.16 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.83 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.79 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  34.31 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.36 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  40.17 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.9 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  38.32 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.45 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  37.25 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.66 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.27 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.29 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  34.31 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  24.19 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.39 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.88 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>