257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3972 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  94.96 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  69.75 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  67.23 
 
 		 238 aa  334  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 		 238 aa  329  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  66.39 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  65.13 
 
 		 238 aa  318  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  63.87 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  65.97 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  59.24 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  43.59 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  43.28 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  42.02 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  37.82 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  40.83 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  37.12 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  36.09 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  38.89 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  36.4 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  37.45 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  34.07 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.57 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  31.3 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  37.99 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  36.68 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  35.78 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  35.93 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  36.41 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.77 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  34.93 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  33.91 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.5 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  36.63 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  35.22 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  34.35 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  33.5 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  32.48 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.59 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  32.05 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  36.36 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  36.36 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  36.36 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  26.29 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.81 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 220 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.47 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.47 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  29.2 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  28.03 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  30.84 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  33.05 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  28.76 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>