More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1771 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.65 
 
 
232 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  42.13 
 
 
232 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  40.27 
 
 
234 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  40.62 
 
 
234 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  41.56 
 
 
232 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  40.89 
 
 
231 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  37.39 
 
 
256 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  40.72 
 
 
245 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  40.61 
 
 
230 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  40 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  39.3 
 
 
233 aa  151  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  44.65 
 
 
245 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  40.17 
 
 
230 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
231 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  40 
 
 
231 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  42.45 
 
 
231 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  40.87 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  39.74 
 
 
227 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  43.06 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  39.73 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  38.89 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.1 
 
 
239 aa  138  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.13 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  42.74 
 
 
240 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  39.91 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  41.45 
 
 
251 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  39.06 
 
 
240 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  42.08 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 
230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  37.07 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  38.33 
 
 
256 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  38.05 
 
 
239 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  38.12 
 
 
237 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  41.28 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  37 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  35.29 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  34.76 
 
 
238 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  34.76 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  35.17 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  35.17 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  35.17 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  35.17 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
235 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  34.75 
 
 
238 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  35.44 
 
 
238 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  37.8 
 
 
238 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  34.8 
 
 
238 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.84 
 
 
240 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  35.47 
 
 
238 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
240 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  30.91 
 
 
240 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
239 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  33.05 
 
 
238 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  34.27 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  34.27 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  34.27 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  30.4 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.17 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
240 aa  99  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  33 
 
 
240 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  30.38 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  30.38 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  30.38 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.38 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.15 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  29.92 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  32.47 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
240 aa  92  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  30.08 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  28.26 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.16 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.76 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.6 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  29.91 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.93 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  23.39 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.58 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.79 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  32.77 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  31.75 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  34.72 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  34.72 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  34.72 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  34.72 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  34.72 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  39.64 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  35.71 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>