More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2075 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.14 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  40.39 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  41.78 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  37.95 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.39 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  38.33 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  38.5 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  38.94 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  38.12 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  38.65 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  39.04 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  36.82 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  38.16 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  37.95 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  33.78 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  38.22 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.19 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  36.89 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.08 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  32.62 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  34.31 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.76 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  31.74 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  33 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  32 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  35.12 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  31.88 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  31.84 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  30.96 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  30.73 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  31.19 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  29.63 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  29.63 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  29.63 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  29.63 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  28.5 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  30.04 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  30.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  29.63 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.15 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.54 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  29.76 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  29.76 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  29.76 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  29.5 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.36 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  27.65 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  28.05 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  26.99 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  31.3 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  32.23 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.09 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.55 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32.03 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  26.1 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  37.89 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  26.22 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  33.33 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.77 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.35 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>