240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4163 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  100 
 
 
238 aa  490  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  94.96 
 
 
238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  68.91 
 
 
238 aa  341  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  67.23 
 
 
238 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  68.91 
 
 
238 aa  330  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  66.39 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 
238 aa  301  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 
238 aa  301  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 
238 aa  301  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.39 
 
 
238 aa  294  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  59.24 
 
 
238 aa  289  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  43.7 
 
 
238 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  42.02 
 
 
238 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  37.82 
 
 
238 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  37.22 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  37.39 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  40.34 
 
 
238 aa  158  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  36.44 
 
 
240 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  36.09 
 
 
239 aa  154  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  37.29 
 
 
240 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  34.87 
 
 
240 aa  151  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  36.44 
 
 
240 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  35.59 
 
 
243 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  35.59 
 
 
243 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  35.59 
 
 
243 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.59 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  37.29 
 
 
240 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  36.86 
 
 
240 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  33.63 
 
 
246 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
237 aa  138  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  31.8 
 
 
257 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  30.77 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  34.06 
 
 
234 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  35.81 
 
 
233 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35.78 
 
 
232 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
238 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  35.34 
 
 
232 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  34.5 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  36.14 
 
 
227 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
237 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.02 
 
 
239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.5 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  34.47 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
259 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  34.35 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  33.19 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  33.62 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  31.17 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
231 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
251 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  33.01 
 
 
235 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  33.05 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.34 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  32.34 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  33.82 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.44 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  29.54 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.31 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  27.52 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  35.54 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  35.54 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.84 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  35.54 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  33.05 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  35.54 
 
 
226 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  29.3 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  27.56 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.08 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.36 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 
230 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  22.41 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  27.69 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>