233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0544 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  75.21 
 
 
238 aa  348  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  65.55 
 
 
238 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  65.13 
 
 
238 aa  324  7e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  67.23 
 
 
238 aa  324  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  321  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  321  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  321  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  64.71 
 
 
238 aa  321  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  64.29 
 
 
238 aa  317  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  65.55 
 
 
238 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  66.81 
 
 
238 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.39 
 
 
238 aa  291  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  56.72 
 
 
238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  46.64 
 
 
238 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  48.74 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  43.7 
 
 
239 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  40.25 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  39.83 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  39.92 
 
 
235 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  38.24 
 
 
240 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  38.24 
 
 
238 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  39.32 
 
 
238 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  40.71 
 
 
240 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  38.56 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  38.56 
 
 
243 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.56 
 
 
243 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  38.56 
 
 
243 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  38.56 
 
 
243 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  37.71 
 
 
239 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
240 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
240 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.5 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  32.11 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  35.04 
 
 
238 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  36.12 
 
 
237 aa  141  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  40.49 
 
 
227 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  35.47 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.24 
 
 
230 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  33.62 
 
 
234 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  37.75 
 
 
230 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  40.59 
 
 
259 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
237 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  36.97 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.98 
 
 
243 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  36 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
233 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  34.06 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  32.19 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35.22 
 
 
232 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  34.35 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  34.05 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  32.75 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  32.75 
 
 
230 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  33.05 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.84 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  33.82 
 
 
240 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
256 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  31.44 
 
 
231 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  35.64 
 
 
235 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
231 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
231 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  34.33 
 
 
231 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.5 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.92 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  34 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  30.24 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.76 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  26.38 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  28.09 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.81 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  25.41 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  28.5 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  28.5 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  28.5 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.51 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.69 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.19 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.4 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  22.05 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  22.09 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.87 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>