265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2501 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.08 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  56 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  57.64 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  53.95 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  54.15 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  53.97 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  53.19 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  52.77 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  54.29 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  51.91 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  58.82 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  55.16 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  51.07 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  55.22 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  52.26 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.08 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  42.23 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.03 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.13 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  34.31 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  35.09 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  35.22 
 
 		 233 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  34.2 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  34.07 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  36 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  36 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  34.2 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.5 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  34.08 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  34.08 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  34.08 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  34.08 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  34.08 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  34.53 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  34.53 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  34.53 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  34.6 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  34.48 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  34.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  32.51 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  32.51 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  32.51 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  33 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  32.51 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  31.96 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  31.96 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  34.47 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  32.02 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.67 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  30.3 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.99 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  32.51 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  32 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  36.89 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  31 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.18 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.54 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  32.18 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  34.58 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  30 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  32.18 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  32.18 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  34.62 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  33.99 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  32.69 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.86 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.17 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.54 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.06 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18953  predicted protein  31.14 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.988963  normal  0.793664 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  26.96 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.25 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  33.04 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>