46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18953 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_18953  predicted protein  100 
 
 
330 aa  667    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.988963  normal  0.793664 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44799  predicted protein  29.86 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.02 
 
 
233 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  25.62 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  27.38 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
231 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  27.38 
 
 
232 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  26.76 
 
 
231 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  26.76 
 
 
231 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
237 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  25.54 
 
 
230 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47922  predicted protein  27.03 
 
 
394 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.26 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.69 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.14 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  25.18 
 
 
234 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
234 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  34.57 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  25.53 
 
 
230 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  33.14 
 
 
240 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  26.36 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  33.14 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37459  predicted protein  22.04 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  24.57 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  28.82 
 
 
230 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.21 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.24 
 
 
230 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.89 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  27.61 
 
 
231 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  25.29 
 
 
239 aa  46.2  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  31.95 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  24.32 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  26.46 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>