85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37459 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_37459  predicted protein  100 
 
 
422 aa  875    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
231 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  27.87 
 
 
231 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
231 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  26.59 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  28.34 
 
 
230 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
233 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  25.6 
 
 
232 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  27.05 
 
 
232 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  27.53 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.46 
 
 
234 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  27.53 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44799  predicted protein  29.05 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.83 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.62 
 
 
232 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
231 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  26.21 
 
 
235 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  24.19 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
227 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  27.39 
 
 
230 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.97 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
231 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
256 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
259 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.43 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47922  predicted protein  24.63 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
237 aa  56.6  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  25.42 
 
 
245 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  24.17 
 
 
240 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  25.83 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  25.83 
 
 
251 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  25.41 
 
 
240 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  25 
 
 
240 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  28.03 
 
 
245 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  23.55 
 
 
238 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  23.55 
 
 
238 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  23.55 
 
 
238 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18953  predicted protein  22.18 
 
 
330 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.988963  normal  0.793664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  22.41 
 
 
249 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  23.75 
 
 
231 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  24.58 
 
 
238 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  24.58 
 
 
238 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  24.38 
 
 
240 aa  49.7  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  24.58 
 
 
238 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  24.58 
 
 
238 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  24.58 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
240 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  24.07 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.41 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  26.86 
 
 
239 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
240 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  26.78 
 
 
235 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
240 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.41 
 
 
230 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  30.39 
 
 
230 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  27.91 
 
 
231 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.56 
 
 
240 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.37 
 
 
230 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  31.37 
 
 
231 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  31.37 
 
 
231 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  25.6 
 
 
238 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  31.37 
 
 
230 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  24.7 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  24.48 
 
 
238 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.27 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  23.36 
 
 
238 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.36 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.79 
 
 
243 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.52 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  23.39 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.9 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.61 
 
 
237 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
243 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
243 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
243 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.56 
 
 
243 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  32.65 
 
 
238 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>