More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3585 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  100 
 
 
237 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  41.1 
 
 
232 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  41.1 
 
 
232 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  40.68 
 
 
234 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  40.52 
 
 
230 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  39.83 
 
 
231 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  38.79 
 
 
230 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  38.98 
 
 
231 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
231 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  38.56 
 
 
231 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
234 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
233 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  36.24 
 
 
233 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.5 
 
 
232 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  36.24 
 
 
238 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  36.89 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  38.19 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  34.33 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  37.55 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  34.33 
 
 
238 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.12 
 
 
239 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  38.35 
 
 
259 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  33.62 
 
 
239 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  33.02 
 
 
235 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  32.75 
 
 
238 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  32.75 
 
 
238 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  32.75 
 
 
238 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  32.75 
 
 
238 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  33 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  32.75 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  36.18 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.91 
 
 
238 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  36.95 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.52 
 
 
238 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  33.48 
 
 
238 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  37.69 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  33.03 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  37.25 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  36.68 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  36.68 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.76 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  32.51 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  36.68 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.68 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  35.68 
 
 
240 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.12 
 
 
241 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  33.67 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  33.48 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  34.2 
 
 
238 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  34.2 
 
 
238 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  34.2 
 
 
238 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  35.18 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  33.33 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  33.91 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  34.05 
 
 
238 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.6 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  33.17 
 
 
239 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
249 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
240 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  31.68 
 
 
238 aa  105  8e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  35.61 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  34.47 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
235 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
240 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
240 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
251 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  31.66 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.1 
 
 
257 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
235 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  30.14 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  29.33 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  30.41 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  38.53 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  34.72 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  25.85 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  40 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.33 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  28.37 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.51 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.25 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.83 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.14 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  31.06 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  28.39 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  35.2 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>