More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02868 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  76.32 
 
 
239 aa  360  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  45.95 
 
 
231 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  52.5 
 
 
235 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  49.28 
 
 
231 aa  188  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  46.12 
 
 
259 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  48.29 
 
 
231 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.45 
 
 
230 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  45.71 
 
 
240 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  45.41 
 
 
256 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  45.02 
 
 
230 aa  174  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  45.78 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  46.5 
 
 
240 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.37 
 
 
232 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  44.93 
 
 
251 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  41.7 
 
 
234 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.23 
 
 
243 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  43.48 
 
 
240 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  41.85 
 
 
231 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  41.85 
 
 
231 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  40.97 
 
 
231 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  40.97 
 
 
231 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  39.01 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  38.12 
 
 
230 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  40.44 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  37.89 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.72 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  43 
 
 
240 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  37.67 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  37.22 
 
 
232 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  38.84 
 
 
233 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  35.4 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  33.78 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  35.81 
 
 
239 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  38.73 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.7 
 
 
235 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  35.92 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  36 
 
 
238 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  36 
 
 
238 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  36 
 
 
238 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  35.15 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  32.74 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  34.47 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  30.25 
 
 
246 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  31.86 
 
 
238 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  31.86 
 
 
238 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  31.86 
 
 
238 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  31.86 
 
 
238 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
243 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
243 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  31.86 
 
 
238 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
240 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
243 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  31.22 
 
 
238 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  28.7 
 
 
238 aa  103  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
243 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  30.73 
 
 
238 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  33.33 
 
 
240 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  34.05 
 
 
240 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  35.41 
 
 
249 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  28.82 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  29.95 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  33.62 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  32.32 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  35.19 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.86 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.88 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.7 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  43.75 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.72 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  40.2 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.75 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.37 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  43 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.88 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  36.63 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.56 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  40.4 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.52 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.26 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.61 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.76 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>